分析人士指出，这些分歧都不可避免地会为试探性谈判带来一定负面影响。要想谈判顺利进行，各方恐怕都需要作出不小的妥协。

事后人们查证，在杨正清的手机上，最后的一个通话，是12月24日晚打给贫困户陈士香的。而之前，他在村委会与当天同时下组调查的干部，一起整理白天找水的资料，商议方案。

《共青团、少先队组织开展五中全会精神宣传宣讲》国民党文传会副主委唐德明痛批，渔民权益被牺牲，但翻遍所有报纸，不论是蔡英文办公室、台当局行政主管部门或者所谓的“驻日代表”谢长廷，都没对任何渔民表示歉意的相关说法，好像渔民权益只是无足轻重的一件小事而已。唐德明表示，民进党当局上台后，一再强调“与日本关系友好”，但用人民权益换来的，都只是看得到吃不到的所谓“政治好处”，“对所有台湾民众来说，蔡当局对日本的谄媚，都像是热脸贴冷屁股而已。”